Song song với việc thực hiện đường cống ngầm, dự án nhà máy xử lý nước thải Yên Xá thì UBND TP. Hà Nội cũng cần phải tính toán lượng nước sau xử lý sẽ phải bổ cập lại cho sông Tô Lịch như thế nào.
Trong buổi kiểm tra tiến độ thi công Nhà máy xử lý nước thải Yên Xá, Chủ tịch UBND TP. Hà Nội cho biết, thành phố sẽ nghiên cứu phương án thi công cống thu gom nước thải dọc bờ sông Tô Lịch.