Dự án lại tiếp tục vướng mắc nên tạm ngưng thi công từ giữa tháng 11/2020, thiệt hại hơn 45 tỷ đồng ở tháng đầu tiên. Trong khi đó, vấn đề đảm bảo an toàn đường thủy bị đùn đẩy.
Công ty TNHH Trung Nam BT 1547 đề nghị chính quyền TP.HCM chỉ đạo CA vào cuộc điều tra làm rõ cáo buộc của liên danh TVGSHĐ về việc một số nhân viên tư vấn giám sát bị các đối tượng xã hội đe dọa.
Công ty TNHH Tư vấn xây dựng Meinhardt Việt Nam đã gửi báo cáo đến UBND TP.HCM tố cáo công ty TNHH Trung Nam BT 1547 sai phạm trong quá trình đổ bùn thải, nạo vét dự án chống ngập 10.000 tỷ đồng.